郭璞东渡后，早先本在今南京城北下关区幕府山的“金城”，为王敦做事。后来随王敦去了武昌的幕府，最后就是在那儿被杀的。
郭璞是在山西为母亲守丧期满回宁后，被王敦征招到武昌幕府的，之前一直是王导的人。郭璞随征前，就预测此去凶多吉少，便给儿子作了交代，除了指明身后葬地，还告诉了死后下葬的办法：将尸体装殓进棺后，用船运棺至金山寺西南处的江面上，直接把棺材放入江里，其他事别管。还特别嘱咐，不管发生了什么事，也不要回头看，否则要坏大事。
郭璞死后，郭骜等家人前去收尸，一一照办。
但棺材刚一入水，突然有惊涛骇浪，冲天而起。郭骜立即背过身去，接着又是如炸雷般的一声巨响，郭骜不知道发生了什么，惊恐之下，忍不住扭头看了一下。
刚才放棺的位置，原来还是一片江水，此时却出现了一个小山头，正在往上长。但郭骜这么一回头，山头立即不长了。此小山，即是今镇江金山塔影湖之侧的云根岛。因为这个意外，现在游人看到的云根岛才很矮，离江面只有几米高。
现代有人借此故事，把郭璞下葬方式发扬光大，称他是中国古代正式实行“水葬”的第一人。
郭璞葬处又称“龙门”，紧靠江边，连站人祭拜的地方都没有。明代有一位名叫中心叟的日本使者，曾到金山祭拜郭璞。中心叟在《吊郭璞墓》诗中称，“遗音寂寂锁龙门，此日青囊竟不闻，水底有天行日月，墓前无地拜儿孙。”
历代都有名士前来金山凭吊郭璞。明万历三十三年巡按御史、曾任顺天府尹的黄吉士，为郭璞立了块墓碑，上刻“晋赠弘农太守郭璞之墓”，此碑至今尚存。
郭璞虽然葬在水边，但其墓过去却从未被水淹没过，这真是一大奇事。清刘名芳编《金山志》因此有这样的文字记载，“相传郭璞葬此，有石碣，虽江水泛滥，不没。”
“父作子笑，子作父笑”
宋张蕴《金山诗》中亦称，“江心台殿渺空云，夜月鱼龙影不分，八十老僧相引说，潮痕不上郭公坟。”
郭璞墓葬金山脚下的故事，很显然，是一种传说。而传说，还不仅仅这一个版本。
郭璞死后，晋室念其大义，在追赠他为“弘农太守”时，晋明帝司马绍又封其子郭骜为“临贺太守”，也算是对郭璞的一种补偿。
郭璞与郭骜，是一对很有意思的父子，两人老唱反调。处处不遂郭璞心愿。在如何处理自己后事一事上，郭璞原意是想葬在金山腰上高爽处(也有说山顶)，但想到郭骜平时老与自己作对，才有意说了反话，“我卒，可葬于金山脚下”，估计郭骜会反其意而行之。
可郭骜这回偏偏不与郭璞作对了。正处丧父悲伤中的郭骜，想想自己以前老与父亲“过不去”，心里内疚。这最后一回，一定要听父亲的话，真的把郭璞葬到四周全是水的金山脚下。
